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Une équipe internationale de scientifiques qui utilise AWS Cloud a identifié en temps record plus de 130 000 nouveaux virus à ARN, notamment plusieurs nouveaux coronavirus, créant ainsi un système de surveillance mondial qui pourrait aider à prévenir les pandémies.
Les chercheurs du projet Serratus ont construit un superordinateur sur AWS en seulement huit semaines. Celui-ci a effectué, en moins de deux semaines et au coût de 24 000 $, des recherches dans presque six millions d’échantillons biologiques accessibles au public afin de détecter la présence de virus à ARN, accomplissant ainsi ce qui aurait exigé bien plus de 2 000 ans à un ordinateur standard, et aurait coûté au moins dix fois plus.
Personne n’avait tenté ce type d’analyse auparavant, car cela représente trop de données pour qu’un ordinateur puisse les analyser. Selon les scientifiques, ce qu’ils ont réussi à l’aide d’AWS Cloud a essentiellement changé la bio-informatique.
Leur recherche, publiée cette semaine dans la revue scientifique Nature, devrait aider les médecins à établir des rapports plus rapidement quand ils traitent des patients ainsi qu’à améliorer les tests de diagnostic et le développement de vaccins, et aider les décideurs à orienter plus efficacement la recherche et la surveillance.
Les virus à ARN sont plus susceptibles d’infecter de nouveaux hôtes en raison de leur reproduction rapide et de leur taux d’évolution. Les maladies causées par les virus à ARN comprennent le rhume, la grippe, le SRAS, la COVID-19, l’hépatite C, l’Ebola, la rage, la polio et la rougeole.
En identifiant de nouveaux virus et leur origine possible, les scientifiques espèrent reconnaître beaucoup plus rapidement les maladies chez les humains, le bétail et les espèces en péril, ainsi que dans les cultures.
L’équipe du projet Serratus a travaillé avec le Cloud Innovation Centre (CIC) de l’Université de la Colombie-Britannique (UBC) au Canada. Cette collaboration entre les secteurs public et privé, entre UBC et AWS, a permis à des scientifiques d’accéder à de la technologie et à de l’expertise en infonuagique.
Ensemble, ils ont créé un site Web en libre accès, The Open Virome, pour échanger des constatations avec la communauté scientifique mondiale et accélérer la recherche dans le domaine des virus à ARN.
